wet-to-dry’s blog

京大大学院生の備忘録ブログ

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Olympus顕微鏡でとったTiff画像をImageJで彩色し、Jpegで保存するマクロ3

概要 以前、記事をツイートしたら、画像に名前を埋め込めば直接パワポに張り付けられて便利だというアドバイスをもらったので、実装してみました。 私も作りました。同じフォルダーに入っているTiffをまとめてjpgに変換して、同時にファイル名を写真に埋め込…

Olympus顕微鏡でとったTiff画像をImageJで彩色し、Jpegで保存するマクロ2

概要 以前書いた記事↓でいくつか処理をしてみたのですが、うまく機能しなかったこともあった。 wet-to-dry.hatenablog.com 原因を探ったところ、Olympusのカメラ側にあったことが判明した。 うちのカメラは、12-bitのモノクロカメラだが、ImageJ(FIJI)のデフ…

Olympus顕微鏡でとったTiff画像をImageJで彩色し、Jpegで保存するマクロ

概要 うちの研究室では、蛍光顕微鏡は主にOlympusを使っているが、 元画像をTiffで保存したい という欲求と Tiffではうまく写真を見れないので、Jpegで保存したい という欲求が拮抗しており、未だにどちらにするか決めかねている。 そこで、 保存はTiffで行…